集成單細胞分析結果可視化展示與交互式解讀為一體的軟件產品,無需依托任何服務機構,快速篩選單細胞分析結果的關鍵信息,自主繪制形式多樣的結果圖片,一站式串聯研究論著文章故事線。
頁簽功能實現
(一)QualityControl
展示單細胞分析流程上游的數據質控和細胞判定環節的數據分析結果。
(二)CellBrowser
展示細胞降維聚類、細胞類群標識基因分析、細胞類群標識基因功能和通路分析、細胞類群在不同樣本分組下的豐度變化以及細胞類群在各個樣本細胞中占比的結果。
(三)Pseudotime
在線實時查看擬時序圖中隨著擬時序軌跡各細胞類群之間可能的演化關系,以及細胞類群或樣本的概率密度分布曲線。通過點擊擬時序圖中分支節點,切換擬時序分支熱圖查看對應的基因模塊,以及這些基因模塊對應的功能通路分析結果。也可查看用戶關注的基因在擬時序圖中表達情況。
(四)CellPhone
用戶可在線實時通過熱圖 (HeatMap)/弦圖
(CircosPlot)查看各細胞類群作為配體受體之間潛在的交互作用。通過點擊指定條目,可在氣泡圖 (BubblePlot)/網絡圖
(PairNetWork)中查看蛋白互作的詳情,并在數據表中查閱到相關數據。
(五)QuSAGE
QuSAGE工具的主要內容是基因表達集合定量分析的可視化展示與交互式解讀。
(六)SCENIC
SCENIC工具的主要內容是轉錄因子調控網絡分析的可視化展示與交互式解讀。