繼上次公布NovelCyto實驗現場過程后(戳這里了解獲取詳情),大家對下機測序數據分析的結果非常關注!!!NovelCyto的實力到底如何?今天烈小冰就用實測數據,帶您進行全方位了解!
實 驗 流 程
樣本信息:小鼠胚胎組織(數據量>100G/樣本)
實驗設計:Batch1、Batch2 (兩次生物學重復,均使用烈冰自研NovelCyto單細胞捕獲方案)
注:以下實測數據結果均來源于同一樣本(小鼠胚胎組織)解離后的細胞懸液,在相同實驗條件下(時間,儀器,試劑,初始上機細胞數等)完成。
實 戰 數 據 測 評
01 測序數據均達國際一線水平
實際數據情況:
捕獲細胞數量:兩次測試分別捕獲10,783個細胞和9,461個細胞;
Mean Reads per Cell:約40K,符合單細胞數據分析標準;
Fraction Reads in Cells:達到了理想值80%以上;
Valid Barcodes:均在90%左右;
基因中位值、中位數UMI、基因總值等關鍵參數的數據分析指標上均表現出色,且重復性很高,也說明測試數據的穩定性。
02 細胞分群清晰、重復性極佳
基于細胞聚類分析的結果,可實現多種細胞的無偏捕獲;且不同樣本間幾乎不存在批次效應,即具備捕獲細胞穩定性和數據高度重現性。
測 評 總 結
以上便是此次烈小冰為大家帶來的數據分析實戰測評結果。總的來說,NovelCyto微孔法重力沉降單細胞捕獲方案在捕獲細胞數,中位基因數,UMI Counts數,mapping率及批次重復性等關鍵指標上,均呈現高質量的結果,具備優良的實驗服務水準,準確反映出細胞的轉錄狀態,且具備強有力的價格優勢!烈冰出品,必屬精品,一站式精準服務,要做就做最懂你的單細胞平臺!
下期,小編將繼續介紹NovelCyto實測樣本在細胞分群注釋等方面的優秀表現~
更多詳情可關注烈冰官方公眾號或聯系駐地銷售,獲取更多平臺信息!