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NovelBrain?單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期圓滿落幕 時(shí)間：2020-01-07

2019年12月16 -20日，NovelBrain®單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期開(kāi)班授課。本期學(xué)員分別來(lái)自上海、北京、南京、山西、江西等地的各大高校、科研院所及各附屬醫(yī)院，包括中科院生物物理所、中科院上海生命科學(xué)研究院、北京航空航天大學(xué)、海軍軍醫(yī)大學(xué)、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、九江學(xué)院等科研院所以及上海市第一人民醫(yī)院、上海市第十人民醫(yī)院、瑞金醫(yī)院、長(zhǎng)海醫(yī)院、中山醫(yī)院、長(zhǎng)征醫(yī)院、仁濟(jì)醫(yī)院、新華醫(yī)院、宣武醫(yī)院、東方肝膽外科醫(yī)院、北京天壇醫(yī)院、山西白求恩醫(yī)院、南京鼓樓醫(yī)院等附屬醫(yī)院。


本次課程由烈冰講師“天團(tuán)”進(jìn)行授課：技術(shù)總監(jiān)張博、項(xiàng)目總監(jiān)洪艷艷、生信主任郭云雷齊上陣，向?qū)W員講授單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析，包括：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序研究進(jìn)展及細(xì)胞捕獲原理介紹、測(cè)序數(shù)據(jù)分析策略解讀、單細(xì)胞測(cè)序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理、分析平臺(tái)實(shí)踐上機(jī)操作及結(jié)果文件解讀、分析結(jié)果圖形化展示以及單細(xì)胞懸液制備和捕獲實(shí)驗(yàn)操作等。



培訓(xùn)內(nèi)容：


單細(xì)胞測(cè)序研究進(jìn)展及細(xì)胞捕獲原理

l  單細(xì)胞測(cè)序研究進(jìn)展；

l  兩大主流平臺(tái)10×和BD單細(xì)胞捕獲原理；

l  10×和BD單細(xì)胞捕獲的優(yōu)缺點(diǎn)；

l  10×和BD建庫(kù)方法；

l  TCR、BCR、靶向測(cè)序、Ab-Seq等技術(shù)相關(guān)知識(shí)介紹；

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)及案例分析

l  單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——腫瘤；

l  單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——神經(jīng)；

單細(xì)胞測(cè)序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理

l  10×和BD下機(jī)原始數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)講解；

l  10×和BD 不同平臺(tái)的數(shù)據(jù)預(yù)處理策略；

l  細(xì)胞數(shù)量判斷；

l  數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估；

l  數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化；

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析策略

l  單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程，包括細(xì)胞類(lèi)型鑒定、擬時(shí)序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等；

l  單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析涉及的相關(guān)生物信息學(xué)算法和數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹和選擇；

單細(xì)胞云平臺(tái)介紹及上機(jī)實(shí)踐操作

l  單細(xì)胞云平臺(tái)功能模塊介紹，包括項(xiàng)目管理、工作流搭建、數(shù)據(jù)進(jìn)程監(jiān)控、結(jié)果報(bào)告和單細(xì)胞瀏覽器等；

l  單細(xì)胞云平臺(tái)實(shí)際操作，包括新建項(xiàng)目、上傳數(shù)據(jù)、搭建Pipeline、數(shù)據(jù)分析；

單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果圖形化展示

l  如何通過(guò)云平臺(tái)獲得可供SCI發(fā)表的圖形化結(jié)果

單細(xì)胞結(jié)果解讀及參數(shù)調(diào)試

l  單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果文件解讀；

l  Task參數(shù)在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的重要性

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)注意事項(xiàng)

l  單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)基本流程；

l  單細(xì)胞懸液制備注意事項(xiàng)；

單細(xì)胞懸液制備和捕獲實(shí)驗(yàn)操作

l  小鼠來(lái)源樣本單細(xì)胞懸液制備；

l  WTA/Ab-Seq實(shí)驗(yàn)演示；


每天課程結(jié)束，烈小冰都會(huì)收集整理學(xué)員的反饋意見(jiàn)，針對(duì)學(xué)員提出的問(wèn)題和意見(jiàn)及時(shí)對(duì)課程進(jìn)行調(diào)整和完善，保證學(xué)員可以在高強(qiáng)度課程中吸收重點(diǎn)內(nèi)容，讓每位學(xué)員聽(tīng)得懂、記得住、做得會(huì)、玩得轉(zhuǎn)單細(xì)胞測(cè)序~



為了使學(xué)員們能有足夠的能量應(yīng)對(duì)高強(qiáng)度的學(xué)習(xí)壓力，烈小冰悉心準(zhǔn)備了豐富的飲品零食、水果，還有豐盛的午飯，為大家創(chuàng)造更好的培訓(xùn)環(huán)境。


課程結(jié)束之后，學(xué)員進(jìn)公司參觀，并獲得本次培訓(xùn)班的結(jié)課榮譽(yù)證書(shū)，以鼓勵(lì)各位學(xué)員認(rèn)真的學(xué)習(xí)態(tài)度。


錯(cuò)過(guò)第一期培訓(xùn)的老師不要著急，烈冰單細(xì)胞測(cè)序&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第二期正在加緊籌劃中~  2020年，烈小冰與您不見(jiàn)不散！