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【再添署名文章】李明清研究員團(tuán)隊(duì)在《Theranostics》發(fā)表最新RIF子宮內(nèi)膜圖譜研究 時(shí)間：2022-11-29



        近日，烈冰合作伙伴復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院李明清研究員團(tuán)隊(duì)在Theranostics（IF=11.6）上發(fā)表了題為“Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with recurrent implantation failure”的論著。該研究通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)（scRNA-seq）對(duì)反復(fù)種植失敗（RIF）患者和對(duì)照組（Ctrl）著床窗口期（WOI）的子宮內(nèi)膜進(jìn)行分析，繪制一份詳細(xì)的Ctrl和RIF內(nèi)膜在WOI期的細(xì)胞圖譜。該研究對(duì)RIF子宮內(nèi)膜微環(huán)境紊亂提供了更加深入的了解，為進(jìn)一步開展不明原因RIF的診斷和治療提供了新思路。

        作為本研究的合作單位之一，烈冰生物參與了單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)及數(shù)據(jù)分析的相關(guān)工作。本期文獻(xiàn)分享，我們也特別邀請(qǐng)到了文章作者本人，從第一視角帶大家一探究竟~

研究背景

隨著人類輔助生殖技術(shù)的快速發(fā)展，輔助生殖技術(shù)（ART）的快速發(fā)展使眾多不孕癥患者借助體外受精-胚胎移植（IVF-ET）及其衍生技術(shù)獲得了后代。然而，IVF-ET的胚胎種植率上升空間有限，據(jù)估計(jì)約有10%的接受IVF治療的患者會(huì)經(jīng)歷反復(fù)植入失敗（RIF）。除了結(jié)構(gòu)和染色體異常，子宮容受性/蛻膜化不良被認(rèn)為是不明原因RIF的重要因素，然而機(jī)制未明。


實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
實(shí)驗(yàn)分組：符合那排標(biāo)準(zhǔn)的6例年齡在32-35歲之間的RIF患者和3例年齡在29-35歲之間對(duì)照組的子宮內(nèi)膜
單細(xì)胞捕獲平臺(tái)：烈冰生物10x Genomics平臺(tái)
捕獲細(xì)胞數(shù)：60222個(gè)子宮內(nèi)膜單細(xì)胞
主要技術(shù)手段：單細(xì)胞測(cè)序、免疫熒光、流式細(xì)胞術(shù)、實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)等
生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)：NovelBrain®生信分析系統(tǒng)
數(shù)據(jù)分析工具：細(xì)胞聚類分析、subCluster分析、差異基因表達(dá)分析、GO/Pathway分析、細(xì)胞通訊分析、QuSAGE分析、STRING蛋白互作分析等


實(shí)驗(yàn)結(jié)果

1.繪制RIF患者WOI期子宮內(nèi)膜圖譜；

2.鑒定、驗(yàn)證并探究7群WOI期子宮內(nèi)膜成纖維細(xì)胞樣細(xì)胞（FIB）亞群的功能和分布；

3.在RIF患者中觀察到子宮內(nèi)膜容受性和免疫調(diào)節(jié)能力較差的FIB亞群占比增加；

4.RIF患者子宮內(nèi)膜中高表達(dá)孕激素受體、高表達(dá)與外泌體分泌和自噬相關(guān)基因的上皮細(xì)胞亞群EC1的占比減少；

5.RIF患者子宮內(nèi)膜中組織駐留NK細(xì)胞亞群占比顯著下降；

6.抑制EC1和FIB分泌能力可以促進(jìn)NK2細(xì)胞占比下降；

7.子宮內(nèi)膜基質(zhì)細(xì)胞、上皮細(xì)胞和免疫細(xì)胞之間的細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)在WOI期子宮內(nèi)膜蛻膜化過(guò)程中起著重要作用。


綜上，本研究對(duì)子宮內(nèi)膜細(xì)胞亞群進(jìn)行全面而詳細(xì)的分析，將有助于我們識(shí)別RIF的可能原因，并為RIF的診斷和治療策略奠定基礎(chǔ)，例如，選擇更合適的胚胎移植時(shí)間，以避免移植窗偏移或子宮內(nèi)膜接受性差。


部分研究結(jié)果圖示

全文總結(jié)

       烈冰生物依托NovelBrain®生物信息數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，應(yīng)用細(xì)胞聚類分析、subCluster分析、差異基因表達(dá)分析、GO/Pathway分析、細(xì)胞通訊分析、QuSAGE分析等多種分析工具，幫助研究團(tuán)隊(duì)在生信分析層面抽絲剝繭，團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步結(jié)合免疫熒光等多種技術(shù)手段，建立了翔實(shí)可信的子宮內(nèi)膜細(xì)胞亞群及微環(huán)境互作圖譜。
      本研究詳細(xì)信息參見原文鏈接：https://www.thno.org/v12p6527.htm
文章解讀由原作者提供

轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明“烈冰生物”

復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院李明清教授為本文的通訊作者，復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院賴真真博士研究生、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院輔助生殖科汪云副主任醫(yī)師、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院瑞金醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心周文潔博士、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院輔助生殖科梁舟主治醫(yī)師為本文共同第一作者。