服務熱線02152235399
Spatial Transcriptomics
空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）是指在組織切片上完成，保留樣本空間信息的組學研究。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況，揭示精細病理區域中激活的信號通路，完成分子特征驅動病理特征的機制解析。空間轉錄組學完成了病理數字化結合病理影像化的技術革新，對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發，免疫治療等新興領域都具有重要作用。
1、 擁有先進的冷凍切片機LEICA CM1950。搭配切片經驗豐富的實驗團隊，對多種組織類型的切片厚度與切片溫度進行測試優化，為獲得示組織內真實表達水平的高質量冷凍切片提供硬件和技術保障。
2、 擁有行業先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數字切片掃描儀，可以同時實現明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像；Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式，進一步提升分辨率和清晰度，保證切片高分辨的數字圖像信息精準采集；
3、 具備豐富的空間轉錄組測序和數據分析經驗，具有完善的空間轉錄組聯合單細胞轉錄組數據分析方案，能夠實現個性化、定制化地數據分析服務。
4、 烈冰提供空間轉錄組全流程服務，包括樣本包埋、切片、選片、HE染色、組織透化、建庫測序、以及后續的FISH驗證等各個步驟，為您提供無憂服務。
1. 冷凍切片的制備：注意提前將冷凍組織與玻片放入-20℃冷凍切片機箱體中平衡30分鐘以上，再進行切片；
2. HE染色、拍照成像：組織切片貼合在玻片上，通過甲醛固定、H&E染色并在明場下拍照得到組織切片的形態結構；
3. 組織優化：采用組織酶解的方式進行透化，使細胞中的mRNA釋放并結合到芯片相鄰的捕獲探針上，反轉錄合成cDNA后，移除組織，進行熒光場掃描成像，根據熒光強度判斷最優的透化時間。
4. 透化和cDNA合成：采用組織酶解的方式，選取最佳的透化時間進行透化，芯片的捕獲探針捕獲到mRNA后，反轉錄合成cDNA；
5. 文庫構建：對cDNA進行隨機引物PCR擴增；
6. 上機測序：采用Illumina Hiseq或NovaSeq測序平臺進行測序。
【1】Molecular cartography uncovers evolutionary and microenvironmental dynamics in sporadic colorectal tumors，Cell，2023, IF=66.85
【2】Spatial transcriptomics deconvolution at single-cell resolution using Redeconve， Nature Communications，2023，IF=16.6
【4】Preneoplastic liver colonization by 11p15.5 altered mosaic cells in young children with hepatoblastoma，Nature Communications，2023，IF=16.6
【5】Comprehensive characterization of tumor microenvironment in colorectal cancer via molecular analysis，eLife，2023，IF=7.7
【6】Schwann cells regulate tumor cells and cancer-associated fibroblasts in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment，Nature Communications，2023，IF=16.6
【7】Targeting neoadjuvant chemotherapy-induced metabolic reprogramming in pancreatic cancer promotes anti-tumor immunity and chemo-response，Cell Reports Medicine，2023，IF=14.3
【8】Single-cell and spatial dissection of precancerous lesions underlying the initiation process of oral squamous cell carcinoma，Cell Discovery，2023，IF=33.5