單細胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞,可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結合基因的表達譜和V(D)J數據進行復雜組織樣本的影響免疫應答分析,監測免疫療法的效果,研究疾病發生和發展的分子機制。
(圖片來源:Wang Y, et al., Journal of Infection, 2023)
1. 1000+ TCR/BCR項目經驗,一次實驗可同時獲取1000-10000個細胞的文庫構建,獲得轉錄組和免疫組數據。
2. 具備完善的免疫組庫測序和實驗質控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息。
3. 豐富的免疫組庫測序和數據分析經驗,實現專屬個性化數據分析服務,搭配單細胞分析云平臺,一鍵導出交互性的動態結果報告。
4、免疫組庫測序經驗豐富,助力發表高分SCI文獻:
樣本類型:
組織、血液、培養的細胞系、制備好的單細胞懸液
注:若客戶樣本為組織,且無能力進行組織解離來獲取單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助,但因不同類型樣本的特異性,無法保證實驗方法適用于所有類型組織。
質量要求:
1. 細胞活性大于70%;
2. 濃度為500-2000細胞/μl;
3. 體積不小于200μl;
4. 細胞培養基及緩沖液不能含Ca2+和Mg2+;
5. 細胞體積小于40μm。
V(D)J基因的使用頻率:上圖主要展示了TCR序列中V基因的使用情況
注:橫坐標為V基因,縱坐標為J基因
V-J基因組合頻率:下圖主要展示了TCR序列中V-J基因組合情況。
注:橫坐標為CDR3長度分布,縱坐標為細胞占比
CDR3序列長度:上圖主要展示了CDR3序列的長度分布,以及使用頻率最高的12個TRAV基因對應的CDR3長度信息。
注:橫坐標為clonotype編號,縱坐標為細胞占比
克隆頻率統計:該圖主要展示了TOP50 clonotype對應的細胞占比。
注:Unique或數字: 每個clonotype對應的細胞數(size)
克隆增殖統計:下圖主要展示了不同size對應的clonotype的占比情況
注:右圖中,XY軸均為cluster編號,括號內為該cluster中檢測到TCR序列的細胞數
注:橫向縱向均為樣本名稱,括號內為該樣本中檢測到的clonotype數,色塊內為overlap的clonotype數。
[1] MHC class Ib–restricted CD8+ T cells possess strong tumoricidal activities. PNAS.2023 Aug; IF=11.1
[2] Prmt5 deficiency inhibits CD4+ T-cell Klf2/S1pr1 expression and ameliorates EAE disease. Journal of Neuroinflammation. 2023Aug; IF=9.3
[3] Systemic immune dysregulation in severe tuberculosis patients revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Infection. 2023Mar; IF=28.2
[4] Tumor-intrinsic YTHDF1 drives immune evasion and resistance to immune checkpoint inhibitors via promoting MHC-I degradation. Nature Communications. 2023 Jan; IF=16.6
[5] Single-Cell Landscape Highlights Heterogenous Microenvironment, Novel Immune Reaction Patterns, Potential Biomarkers and Unique Therapeutic Strategies of Cervical Squamous Carcinoma, Human Papillomavirus_x005f Associated (HPVA) and Non-HPVA Adenocarcinoma. Adv Sci. 2023 Jan; IF=15.1
[6] Influenza vaccination features revealed by a single-cell transcriptome atlas. Journal of Medical Virology. 2022 Sep; IF=12.1