热久久免费视频,神波多一花番号,久久国产影视,调教喷奶水h文

服務熱線02152235399

產品簡介

原位空間組學技術(Xenium In Situ)將新鮮冷凍(FF)和石蠟包埋(FFPE)組織中的數百種RNA進行表達分析并精確到亞細胞定位(200納米),相較 Visium 空間轉錄組擁有更高的檢測精度,將會對我們理解腫瘤微環境、免疫、神經科學、細胞特異性、生物發育等方面產生深遠的影響,并進入空間單細胞/亞細胞研究的新時代。


我們的優勢

1. 國內最早引入Xenium平臺的公司之一,烈冰率先完成APT測試實驗,現已正式開展客戶的實驗,實現樣本即送即做,助力客戶早日產出科研成果!

2. 烈冰是10x Genomics 官方指定的Xenium原位分析技術服務商!

3. 烈冰已助力發表多篇單轉結合空轉的高分文獻,具有先進的冷凍切片機和數字切片掃描儀,具備豐富的空間多組學的數據分析經驗!

4. 結合烈冰生物CytoNavigator百萬級大通量生產級數據分析系統,能夠實現個性化、定制化地數據分析服務,確??蛻舻难芯窟_到最佳效果!

樣本要求

樣本類型:

新鮮冷凍(FF)樣本:新鮮組織OCT包埋后-80℃速凍,可連同包埋模具一同保存運輸,在包埋模具上好做方向標記,用于確定切片方向;

石蠟包埋(FFPE)樣本:包埋好的石蠟塊或石蠟切片3-5張,4℃保存,干燥運輸。


其它注意事項:

1. 可聯系烈冰提供Xenium專用玻片由老師自行貼片,樣本處理和運輸過程需要在低溫環境

2. 多樣本拼片,需保證同一玻片選擇的Panel相同

3. 組織大小要長寬小于10.45mm*22.45mm(實際捕獲區域大?。?/span>

4. 切片質檢:HE染色質控判斷組織形態、空間信息保留是否完好,DV200 > 30%(DV200 為檢測樣品中大于 200nt 的 RNA 百分比)

5. 目前商業化panel僅支持人和小鼠物種(可定制增加100 genes),具有注釋良好的轉錄組的其它物種需要提前定制設計(具體細節請在送樣前與我司進行提前溝通)

實驗流程

數據分析流程

Xenium運行結束無需測序即獲得可解讀,能可視化的結果,同時也兼容Seurat,Stlearn等第三方算法包,對于目的數據進行基于細胞和空間維度的分析與深層次解讀,兼具易用性和深度。


結果示例

1、單細胞、空轉和原位分析(Xenium)聯合解析乳腺癌石蠟切片腫瘤微環境
發表時間:2023 年 12 月
發表期刊:Nature Communications
影響因子:16.6
發表單位:10X Genomics
研究背景:單細胞測序解決了細胞異質性問題,但是缺乏空間信息,空間轉錄組測序可以提供空間信息,但分辨率有限,因此這兩種技術也具有很好的互補應用效果,但這兩種技術在解析原位信息方面仍有所欠缺。理想的解決方案是提供高倍、高通量、可讀取空間信息,而不影響組織的完整性,具有亞細胞分辨率,同時兼容新鮮冷凍(FF)和福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織的方法。
研究方法:scFFPE-seq、Visium ST測序 和原位分析(Xenium)
研究結果:使用scFFPE-seq和Visium對乳腺癌FFPE組織進行全轉錄組分析,Visium鑒定了17種不同的細胞類型,Xenium以單細胞分辨率空間解析這些細胞類型及其基因表達譜。由于Xenuim工作流程的非破壞性,可以在同一切片后處理上進行H&E染色和免疫熒光染色,實現在同一張切片上進行蛋白質、組織學和RNA成像。研究人員選擇了Human Breast Panel 280個基因和33個定制化基因共計313個基因,經過基因解碼和成像之后,展示了完整的乳腺癌結構信息。此外,研究團隊使用 Xenium 確定了傳統病理學方法無法鑒定的三陽性(HER2+/ER+/PR+)區域,由于該區域面積較小,在空間轉錄組數據中容易被忽視,為導管原位癌(DCIS)的腫瘤浸潤提供了新的研究見解。

文獻示例


[1] High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue(單細胞、空轉和原位分析(Xenium)聯合解析乳腺癌石蠟切片腫瘤微環境)發表時間:20231219;發表期刊:Nature Communications;物種:人;組織:乳腺癌組織


[2] Decoding spatial organization maps and context-specific landscapes of breast cancer and its microenvironment via high-resolution spatial transcriptomic analysis(高分辨率空間轉錄組學分析(Xenium)解碼乳腺癌和從屬微環境的空間組織解構及其成因)發表時間:20231030;發表期刊:bioRxiv;物種:人;組織:乳腺癌組織


[3]Single cell-resolution in situ sequencing elucidates spatial dynamics of multiple sclerosis lesion and disease evolution(單細胞尺度級別的原位測序(Xenium)揭示了多發性硬化癥病變和疾病演變的空間動態)發表時間:20230630;發表期刊:bioRxiv;物種:小鼠;組織:頸脊髓


[4]Mapping ovarian cancer spatial organization uncovers immune evasion drivers at the genetic, cellular, and tissue level(原位空間組學揭示了卵巢癌的免疫逃逸在基因-細胞-組織水平上的驅動機制)發表時間:20231019;發表期刊:bioRxiv;物種:人;組織:卵巢癌組織