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【新品發布】遙遙領先的轉錄組數據分析系統,毫秒級響應的交互式數據分析!

時間:2024-03-14    |    閱讀量:774

轉錄組分析平臺常見,但操作絲滑流暢的分析平臺,還得看烈冰的CytoNavigatorTM2023年9月發布至今,半年時間已有100多個課題組使用烈冰生物的CytoNavigatorTM單細胞數據分析系統挖掘單細胞生物學意義。烈冰團隊再接再厲,開發了CytoNavigatorTM轉錄組分析系統,全流程打通了轉錄組數據分析,并實現了毫秒級響應的GO/Pathway、網絡分析,以及高可交互的WGCNA、GSEA、趨勢分析等高級數據分析!


圖1:CytoNavigator 轉錄組數據分析系統的差異基因頁面


轉錄組分析流程成熟,分析平臺眾多。但目前的分析系統普遍存在結果碎片化、分析不夠流暢,可交互性差,需反復上傳基因表格等問題。基于上述情況,擁有多年轉錄組及生信云平臺經驗的烈冰生物重拳出擊!

正式推出CytoNavigatorTM 轉錄組數據分析系統!一次解決RNA-seq分析的痛點,讓您享受數據分析的過程,輕松獲得高質量文章級圖片。


01 烈冰的傳統強項-轉錄組測序服務


烈冰生物自2010年起即深耕轉錄組領域,公司自主研發了多個轉錄組相關算法,如發表在期刊核酸研究以及Briefings In Bioinformatics上的差異可變剪接算法ASD和CASH等;并助力研究團隊發表Nature、Cancer Cell在內的300+ 高質量轉錄組相關學術期刊文章,如助力中科院頂級研究團隊在Nature發表全球首例自閉癥猴模型等


圖2:引自 Liu Z, et al. Nature., 2016

2023年9月,烈冰上線了CytoNavigatorTM單細胞數據分析系統,并在全國開展了多次線下培訓班,獲得了大量老師的認可和使用。

本次我們推出的轉錄組數據分析系統側重分析的全面性、靈活性和流暢性,用戶可在平臺上流暢進行各類數據分析,快速挖掘數據背后的生物學意義。


02 烈冰轉錄組數據分析系統優勢


可交互頁面全面覆蓋各類分析

圖3:WGCNA分析頁面,選擇基因module后實時展示該基因module所影響的Pathway

系統全面覆蓋差異基因、功能分析、聚類分析、網絡圖、GSEA、趨勢分析、WGCNA等多種高級數據分析模塊。每個分析模塊均可隨意調整參數,并進行深度分析。


功能分析和網絡分析圖毫秒級展示


圖4:對差異基因進行交并集分析,并對結果進行各類功能分析

毫秒級計算比較組之間的交集和并集,調整差異基因的卡值(Pvalue、FDR)后實時計算網絡圖、各種功能分析和聚類分析圖,順滑繪圖。


用戶界面友好,分析功能全面


圖5:清晰的分析流程,全面覆蓋各類高級分析,并支持一鍵提交分析

支持多種主流的數據分析工具和算法包,用戶可一鍵提交整個分析流程,也可根據需要修改各類參數進行定制化分析,兼顧一鍵分析和反復調參。


清晰全面的幫助文檔,降低學習成本

圖6:每個分析工具均提供全面的幫助手冊

幫助手冊助力用戶進行高效的結果解讀。


分析高度可定制化

圖7:可實時查看每個趨勢所包含的基因,并對其進行功能分析

單頁面同時展示基因表達、趨勢、火山圖、GO/Pathway、KEGG map、PPI網絡等一系列分析。同時每個結果都支持用戶自行調整結果,實時出圖。

當然,CytoNavigator RNA-Seq數據分析系統還不止這些優點,還有樣本分組高可回溯性,支持多用戶協作和數據共享等,更多的平臺功能等你來探索!快來登錄注冊吧~




03 平臺注冊流程

瀏覽器輸入sc.novelbrain.com 進入登錄頁面。



新用戶需要先注冊注冊邀請碼聯系駐地銷售或者發送郵件至tech@novelbrain.com),老用戶直接登錄。


點擊新建項目(不熟悉的可以點擊新手引導查看流程),根據需求選擇single cell或Transcriptome分析;如選擇Transcriptome,點擊云流程選擇fastq起始或者表達量矩陣起始。

填寫項目名稱、選擇分析物種,點擊創建項目,進入主分析頁面。