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NovelBrain?單細胞測序實驗&數據分析培訓班第一期圓滿落幕

時間:2020-01-16    |    閱讀量:3550

2019年12月16 -20日,NovelBrain®單細胞測序實驗&數據分析培訓班第一期開班授課。本期學員分別來自上海、北京、南京、山西、江西等地的各大高校、科研院所及各附屬醫院,包括中科院生物物理所、中科院上海生命科學研究院、北京航空航天大學、海軍軍醫大學、上海交通大學醫學院、九江學院等科研院所以及上海市第一人民醫院、上海市第十人民醫院、瑞金醫院、長海醫院、中山醫院、長征醫院、仁濟醫院、新華醫院、宣武醫院、東方肝膽外科醫院、北京天壇醫院、山西白求恩醫院、南京鼓樓醫院等附屬醫院。


本次課程由烈冰講師“天團”進行授課:技術總監張博、項目總監洪艷艷、生信主任郭云雷齊上陣,向學員講授單細胞測序實驗&數據分析,包括:單細胞測序研究進展及細胞捕獲原理介紹、測序數據分析策略解讀、單細胞測序原始數據預處理、分析平臺實踐上機操作及結果文件解讀、分析結果圖形化展示以及單細胞懸液制備和捕獲實驗操作等。



培訓內容:


單細胞測序研究進展及細胞捕獲原理

單細胞測序研究進展;

兩大主流平臺10×和BD單細胞捕獲原理;

10×和BD單細胞捕獲的優缺點;

10×和BD建庫方法;

TCR、BCR、靶向測序、Ab-Seq等技術相關知識介紹;

單細胞測序實驗設計及案例分析

單細胞測序經典文獻解讀——腫瘤;

單細胞測序經典文獻解讀——神經;

單細胞測序原始數據預處理

10×和BD下機原始數據結構講解;

10×和BD 不同平臺的數據預處理策略;

細胞數量判斷;

數據質量評估;

數據標準化;

單細胞測序數據分析策略

單細胞測序數據分析流程,包括細胞類型鑒定、擬時序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等;

單細胞數據分析涉及的相關生物信息學算法和數據庫的介紹和選擇;

單細胞云平臺介紹及上機實踐操作

單細胞云平臺功能模塊介紹,包括項目管理、工作流搭建、數據進程監控、結果報告和單細胞瀏覽器等;

單細胞云平臺實際操作,包括新建項目、上傳數據、搭建Pipeline、數據分析;

單細胞數據分析結果圖形化展示

如何通過云平臺獲得可供SCI發表的圖形化結果

單細胞結果解讀及參數調試

單細胞數據分析結果文件解讀;

Task參數在單細胞數據分析中的重要性

單細胞測序實驗注意事項

單細胞測序實驗基本流程;

單細胞懸液制備注意事項;

單細胞懸液制備和捕獲實驗操作

小鼠來源樣本單細胞懸液制備;

WTA/Ab-Seq實驗演示;


每天課程結束,烈小冰都會收集整理學員的反饋意見,針對學員提出的問題和意見及時對課程進行調整和完善,保證學員可以在高強度課程中吸收重點內容,讓每位學員聽得懂、記得住、做得會、玩得轉單細胞測序~


為了使學員們能有足夠的能量應對高強度的學習壓力,烈小冰悉心準備了豐富的飲品零食、水果,還有豐盛的午飯,為大家創造更好的培訓環境。


課程結束之后,學員進公司參觀,并獲得本次培訓班的結課榮譽證書,以鼓勵各位學員認真的學習態度。


錯過第一期培訓的老師不要著急,烈冰單細胞測序&數據分析培訓班第二期正在加緊籌劃中~  2020年,烈小冰與您不見不散!