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開啟空間探索的新篇章-實現微米級分辨率的空間轉錄組分析

時間:2024-02-07    |    閱讀量:747

10x Genomics 最新推出的空間轉錄組新產品 Visium HD 芯片,將現有 Visium 平臺的分辨率從 55 um spot 提高到無間隙的 2um方格,從而實現單細胞水平的空間組織結構分析(無間隙的組織覆蓋)!


Visium HD 微陣列由連續的寡核苷酸組成,排列在 ~1100 萬個無間隙的2 x 2 μm條形碼標記的正方形中,8 x 8 μm大小的分析單位是10X官方推薦的可視化和分析的起始點。


一、 Visium HD特點:

1 以單細胞分辨率(2*2μm)對組織進行生物學分析,連續的組織覆蓋率,探索整張組織切片中以往被隱藏的生物學信息


2 高質量的空間數據-CytAssist平臺能夠實現精準的轉錄本定位



3 兼容人和小鼠的各種FFPE樣本


4 兼容H&E染色和IF免疫熒光染色


二、 Visium HD 工作流程


(Visium HD基因表達探針的文庫結構)


三、 高質量數據呈現


利用 Visium HD建立人乳腺原位導管癌的空間全轉錄組精細圖譜,以單細胞分辨率識別腫瘤微環境中的主要細胞類型和狀態;利用 Visium HD能夠準確繪制在小的生物結構中細胞類型的空間組織,如MYH11 的表達特征明確了血管的空間結構;可以定位組織駐留的細胞群,包括免疫細胞或癌細胞,揭示它們的相互作用和對疾病或治療反應的貢獻


四、 技術對比:



Visium HD能夠以單細胞分辨率和高質量數據揭示FFPE組織樣本中微米級的獨特生物學特性,結合烈冰生物CytoNavigator百萬級大通量單細胞數據分析系統,助力客戶更快開拓空間基因表達的新發現!

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